中堂中心小学前身是创办于光绪二十九(1903年)的东莞县立第六国民学校,校址在中堂圩字祖庙(旧镇府内),为5年制初等小学,有教师3人,学生50多人。民国初期(约1912年),改为高等小学,学制9年。民国三年(1914年),更名为东莞县第六小学,翌年,改学制为初小4年,高小3年。民国十二年(1923年),改学制为初小4年,高小2年。
1938年底,中堂沦陷后,转为私办学校,有教师6人,学生100多人。
1945年8月抗战胜利后,由私校转为永宁乡第一中心国民学校。
中华人民共和国成立之初,学校一度更名为东中镇小学。1951年2月更名为中堂中心小学,并直接领导全区小学。1968年中堂公社教育组成立,中堂中心小学不再直接领导社内各小学工作。
1990年,学校迁入中堂中学旧址。
2006年为创建教育强镇,实施联合办学,投资3千多万元,在学校北区西侧连片增地,建设全新校园,同年被评为“市一级学校”。
目前,中堂中心小学占地总面积32000多平方米,建筑总面积达20000多平方米,有43个教学班,2000多名学生。教师总数112人,小学高级教师73人,占教师总数的65.2%,大专以上学历的107人,占教师总人数的95.5%。配置了电脑室、舞蹈室、美术室、语言室、多媒体演播室等40多个功能室,按市一级学校的标准配备了电教器材、体育器材、卫生设施、实验仪器等设备。建成了200米环形塑胶跑道附100米直跑道的田径场一个,标准篮球场3个,排球场2个,羽毛球场2个,以及占地300多平方米的室内活动场所。设有先进的广播系统和校园网络,电脑等多媒体进入每间教室,图书室的藏书6万多册,电子读物5万多册,教师办公电脑人手一台,教辅设施充分满足了教学需要。