学校最早创办于1927年，原名为大鹏鹏城小学。在上级部门和热心港商的努力下，具有24个班规模的新校舍于2001年9月落成，并更名为大鹏第二小学。学校占地24626m²，建筑面积7800m²。现有教职工53人，教师45人，在编21人，聘用24人，学历100%达标，大专以上40人，占93%，其中本科15人，占35%，教师平均年龄30岁。现有学生685人，共16个班，户籍学生132人，占有19%，暂住学生553人，占81%。学校2002年5月通过区一级学校评估，2004年6月通过市一级学校评估，2005年12月通过省一级学校评估。
学校坚持邓小平的“教育要面向现代化，面向世界，面向未来”的教育方针，和“面向全体，全面发展。一切为了孩子，为了一切孩子，为了孩子的一切”的办学思想。坚持“以质量求生存，以特色求发展”的办学理念，积极实现“常规规范、质量良好、特色明显、有示范性”的办学目标。
学校坚持制度加人性化的管理。制度健全，管理民主，建立了行政会议制度、教职工代表会制度、家长委员会制度;各部门职责分明、各司其责;大事由教职工代表会讨论，校务公开;实行月度、期末考核;坚持开放办学，每学期对学生进行普访，每学年举办一次教学开放日，召开一次家长会。让学生、家长评价学校、教师的工作。收费、招生、教学成绩向社会、家长公开。
学校德育工作初步形成了“以爱国主义教育为主旋律，以养成教育为重点，以关爱、体验教育为载体”的工作模式积极开展工作。利用大鹏所城、核电站等周边教育资源开展我爱大鹏所城、革命故事会、“寻找先辈足迹”等爱国主义教育活动;组织各种关爱活动和体验教育活动;重视做文明小公民的养成教育;坚持定时组织法纪、禁毒、安全教育。
坚持“以质量求生存”的理念，学校工作以教学为中心。全面执行国家教学计划，狠抓教学常规管理;坚持“科研兴校，科研强师”，立足校本教研，引进国家级课题“小学语文发展与创新教育”、省级英语课题“任务驱动式教学”，推进课程改革;开展丰富多彩的第二课堂活动，文化节、艺术节、科技节、体育节、读书节、学科活动周、擂台赛、背百首古诗、学会一种乐器等特色活动，提高了学生素质。
近几年来，教育教学质量稳步提高。在龙岗区教育局组织的学业评价考试中，学校整体成绩在街道中名列前茅;师生区级以上比赛获奖323项，教师获得各类荣誉称号61人次，教师54篇论文在国家、省和市级刊物发表，24篇论文在区级以上获奖;篮球队、田径队、游泳队、航模队在市、区级比赛中屡屡获奖;学校获得中国教育学会“艺术教育先进单位”、小学语文教学法研究中心授予的“先进实验学校标兵”，市委、市政府授予的“安全文明标兵小区”等集体荣誉20多项。
