1999年2月,中山火炬开发区党委、管委会决心创建省教育强区，全力整合教育资源,把大岭、西桠、宫花、神涌、大环、江尾头六间小学合并而成中山火炬开发区第二小学,是一所市一级小学。
开发区第二小学占地面积18676平方米,建校初期,学校建筑面积4470平方米,2001年由政府拨款320万元新建成教育综合大楼交付使用,学校建筑面积达到7312平方米。。2002年初新置了微机35台，电脑室（60座）一套，2004年“两机一幕”进入班级，增设了综合电教室,音乐室,美术室,学校初具教育现代化规模。
现有教学班25个，学生数1301人。在编在岗教工60人，专任教师55人，其中本科学历23人，大专学历27人，其它学历5人，达标率100%。35岁以下青年教师31人，50岁以上教师2人，小学高级教师33人，一级教师15人。
学校全面贯彻党的教育方针，以“健康、勤奋、有信、奋进”办学宗旨，“严、新、活、实”教风，全面推进实施素质教育，建设现代化学校，培养具有开拓精神、坚强意志、崇高理想的四有新人。在少先队活动主体性，兴趣活动多样性，课堂教学自主性中形成特色。
1999年,学校实行校长负责制，校长负责全面工作，党组织保证、监督，教职工民主管理。开发区教办委任黄惠林同志担任开发区二小校长,周锦连、沙泉源担任副校长，周锦连任党书记。内设德育处、教导处、总务处。
2000年学校通过区一级学校验收。
2002年于中山市实行人事改革制度,实行校长负责制、全员聘任制、目标责任制、结构工资制等一系列配套改革。全区中小学校长公开竞争上岗，黄惠林同志竞聘成功,继续担任校长,副校长周锦连同志因公调节到开发区第一小学任校长,唐闻甫通过竞聘担任副校长一职,学校下设教导处、德育处、总务处三个机构。
2003年唐闻甫因公调动离开二小,2003年7月,黄惠林校长退休，由黄方担任校长、书记,沙泉源、刘光旗担任副校长。
2006年副校长沙泉源同志因公调节到开发区第四小学任副校长,周丽微调入开发区二小任副校长。
2008年教办对中层以上干部进行竞争上岗,开发区第二小学领导班子重新调整,黄方同志继续担任开发区第二小学校长,副校长周丽薇、郑硕果。
2008年8月,黄方校长大力推行"扁平化"管理,学校推行扁平化管理模式，实行三级交叉式扁平化管理组织结构。改变以往金字塔层级管理模式。做到管理重心下移，减少多层设置，以保障政令畅通这，逐步提高管理效率。按照扁平化管理模式学校将管理组织机构设置为决策、管理、执行三级，决策层由校长、副校长组成，管理层由副校长、年级主任组成，执行层由年级主任、教师组成。学校中层干部任各年级主任，分管教导处、德育处、少先队、工会等处室，兼任年级组长、学科组长。
