南京市紫东实验学校，成立于二〇〇〇年九月，由两所小学（原岔路口小学、五旗小学），两所中学（原岔路口中学、仙鹤门中学）合并而成。是南京市首家公办九年一贯制学校。二〇〇三年十月，因十运会建钟山国际体育公园，由原址（上三旗47号）迁址现校址办学。二〇〇五年九月，和仙鹤门小学合并，同期教学楼建成并投入使用。
目前，学校教职工有68名（其中小学编制34名，中学编制34名），另有病退休职工29名。全校共有教学班22个（小学14个、中学8个），学生八百多人。主要机构设置有校长室、党支部、少先队大队部、德育处、中小学教务处、中小学教研室、信息中心、总务处、小学年级部、中学年级组以及按学科设置的教研组等。
在玄武区教育局的直接帮助、支持下，学校的办学条件有了显著的变化。目前校园面积76亩，分教学、运动、生活三个区，教学区主体是一栋八千平方米的大楼，有三十个普通教学室。十四个专用教师及办公室若干间，教学设备配置齐全。学生教室全部安装了多媒体吊装；运动区以一座400米的塑胶跑道的体育场为主体，还设置了排、篮球场，单、双杠活动区。生活区包括食堂、师生餐厅和仓库等。
在区教育局的"三先""三用""三成"的整体战略要求的基础上，根据校情，我校确立了"管理玄武争一流，质量亚东争第一"的近旗办学目标。力争在第十一计划中，完成"整理办学质量南京市一流"的中期目标。经过五年多的艰难创业历程，我校的教育教学质量有了显著的提升，得到了上级、社会的初步肯定。二〇〇二年被评为"南京市薄弱学校改造先进集体"。
我校从二〇〇一年开始，引入跆拳道训练的办学特色，在克服活动经费紧张、硬件薄弱、人手不足等具体困难的基础上，持之以恒、咬定青山不放松，取得了显著的成绩，每年参加市青少年跆拳道比赛，都获得至少一块金牌。二〇〇四年，代表玄武区，单独组队参加了市十一届运动会，获得一金五银，为我区获得团体总分第一做出了应有的贡献。区体育局授予我校玄武区跆拳道训练基地，目前正申报"南京市体育传统学校"。
