虹口区第六中心小学前身为广灵路小学，有近50年的办学史。学校素以“管理规范，治学严谨，发展全面”而著称。20世纪八九十年代，学校以最优化整合理论为指导开展教育实践，在学校层面解决了如何在教育的管理、内容、方法和途径等方面进行整合，办学业绩显著而闻名，先后被命名为少先队全国红旗大队、市首批学生行为规范示范校、市体育传统（足球）学校、市小学语文研究会团体会员单位、区文明单位、区德育特色学校、区体育传统（象棋）学校等。
2004年，经虹口区教育局决定，由广灵路小学全部人员承办虹口区第六中心小学，同年9月1日，学校整体搬迁至现校址。学校现占地8478㎡，建筑面积4747㎡。校园环境优美，教育设施齐全，目前有19个教学班，640余名学生，66名教职工，其中中学高级教师2名，区级骨干教师2名。
新校筹建至今已有7年，面对新的教育形势，学校把开展“小学生主体性教育”实践作为新一轮学校教育的主要方向，尝试解决在教育生态系统中进一步关注教育的主体，探索受教育者内部的主体激活，解决主体和环境的互动和融合。在多年开展主体性教育的实践基础上，学校逐步概括出了主体性教育的“四自模式”，即一个基础（以“主体意识——人文精神”为基础）、两个要素（独立人格、自主能力）、三个关键（需要、体验、践行）、四个途径（自律、自学、自强、自励）。2008年，出版了《主体性：教育永恒的命题——学校主体性教育实践与理论研究》一书。在实践与研究过程中，我们的认识也逐步深化，透过对学生主体性的培养实践，探索学校德育的有效性，促进学校教育的融合度，增强学校硬实力与软实力，提升学校教育力，彰显了学校教育特色。
六中心小学还被命名为上海市体育传统（足球）学校，培养过范志毅、朱琪、毛毅军、朱炯、张勇等一批足球人才，现成立王后军少儿足球训练基地，为上海市青少年校园足球布点学校。此外，学校的棒球、中国象棋也在逐步形成特色，校中国象棋队2007年获上海市学生体育运动会第二名。
