民國四十一年七月，塘岐國民學校正式成立，並經指定為北竿鄉國民教育中心學校，下轄后沃、大坵、橋仔、芹壁、板里、白沙六所分校。民國四十九年八月板里分校合併芹壁、白沙二分校升格為板里國校，脫離塘岐國校獨立。
民國五十二年十月，獲農復會補助，將石牆瓦頂之校舍拆除重建，改為單層鋼筋水泥結構。民國五十九年八月，橋仔分校合併大坵分校升格為國小，並改名為禎祥國小，脫離塘岐國校獨立。
六十七年八月校舍加蓋成二樓，外牆貼綠色馬賽克。
七十年八月，后沃分校撤校，一、二年級學生併入校本部上課。七十二年八月，中山國民中小學小學部，由六班縮減為四班，五、六年級轉來塘岐國校就讀。七十五年八月，中山國民中小學小學部，奉令裁撤，全部學生歸併塘岐國校上課。七十五年九月，二層樓教學大樓被判定為危樓，拆除新建，學生暫借北竿運動場及橋仔學校上課。七十六年九月，正面教學大樓竣工，正式啟用。七十八年一月，教學大樓第二期工程(東側部份)竣工啟用。
八十二年十月，整建校門、操場、廁所及週邊工程。八十五年一月，辦公室大樓竣工啟用。八十五年九月，附設幼稚園大樓工程竣工，隨即招收大、中幼生各一班，是北竿鄉唯一公立幼稚園。教學大樓正面加添一層，增建成三樓，於八十七年十一月竣工，成為如今校舍面貌。八十八年九月，增設資源班，增加師資兩名。八十九年六月，經推薦為地區九年一貫國小階段試辦學校，為期兩年。
九十二年四月，本校擇定四月四日為校慶日，並舉行首屆擴大校慶活動。九十三年二月成立校史室。九十六年十一月教學大樓東側增建三樓校史室兼會議室竣工啟用。
