本校創於民國五十五年秋，校名為「金門縣立金寧初級中學」，斯時因校舍未建，於盤山村借租用民房，暫充教室，學生一五七人，班級數少，環境也侷促，端賴全校師生同心同德，篳路籃褸，共襄創校壯舉。五十六年九月新校舍落成，學生人數增為六班二三七人。五十七年實施九年國民教育，本校正式改名為「金門縣立金寧國民中學」，合併古寧小學安美分班，學生人數為廿四班（低年級八班、高年級十六班）九八六人。六十九年增設幼稚班二班，學生人數為一一一三人。本校自成立以來，經歷任校長呂水涵、蔡世炎、李養盛、翁志勵、陳昆仁、鄭啟超（二任）、楊清國、王世宗、楊瑞松諸先生苦心擘劃，慘淡經營，校務蒸蒸日上，規模略具。現任校長許維民先生，自九十五年八月接任後，珍視賢良績效，積極推展校務，培養優良學風，加強教學、訓導、輔導工作，期能實踐「公、誠、勤、樸」的寧中小精神。
