校座落於東引島北邊山腰地帶，背山面海，與鄉村毗鄰，環境清幽怡人，學生遍佈東、西引兩島〔包含中柳、樂華、北澳、獅子四個自然村〕，為東引島唯一學府。
校前身為東湧國小，創始於民國三十八年，創辦之初校舍借用民房，設備簡陋。民國四十四年經東引反共救國軍指揮部協助，遂鳩工興建校舍至四十八年竣工落成遷入現址。民國五十九年本縣為貫推行九年國民義務教育政令，始成立國中部----隸屬連江縣立中正國中。民國六十一年八月本校國民中、小學合併，更名為（連江縣立東引國民中小學），實施九年一貫制教育。本校並於民國六十九年成立連江縣第一所公辦附設幼稚園、隸屬國小部。
