臺灣光復前(日據時代)民國七年三月三十一日以「樹林頭公學校槺榔分校」名義創立。
民國十年四月二十四日獨立,校名為「舊港公學校」。
民國三十年四月一日改名為「南寮國民學校」。
臺灣光復後(民國三十四年十一月十五日由中華民國政府正式接收)民國三十五年三月一日改名為「新竹市立第七國民學校」。
民國三十六年三月一日改名為「新竹市南寮國民學校」。
民國三十九年十月二十五日改稱為「新竹縣新竹市南寮國民學校」。
民國五十七年九月一日改稱為「新竹縣南寮國民小學」。
民國七十一年七月一日升格省轄市,改稱為「新竹市立南寮國民小學」。
民國九十一年七月一日,改稱為「新竹市北區南寮國民小學」。