南澳县第二中学校址为原隆东中学校址，1998年8月由原后宅镇中学、隆东中学合并而成，定名为南澳县后宅镇第一中学，属后宅镇镇管的初级中学。1999年5月划为县直属学校，并更名为现校名即南澳县第二中学。学校领导班子职责分明，团结协作，廉洁奉公，科学管理，工作效率较高。现有行政班子成员14人，其中正副校长4人，设有校长室、教导处、政教处、总务处、团委会。班子成员学历全部合格，均取得中级或中级以上职称，熟悉教育教学工作，有较强的事业心和责任感，能够做到各司其职，团结协作，以身作则，带头艰苦奋斗，勤奋敬业，廉洁奉公，在全体教职工中能起模范带头作用，享有较高威信，是一个比较强有力的领导集体，在学校各项工作中发挥着重要作用。
学校为汕头市绿色学校，校园教学区和运动区分开。校园绿化、净化、美化，环境整洁优雅，教学楼四周有高低不同层次的立体绿化，各楼层花坛种植报春花、吉祥草，校道两侧道边林整齐排列，有小叶榕、芒果、玉兰、蓬架子、羊蹄角等，大片空地均种上优质台湾草，教学区绿化率达到90%，校园宁静、整洁、优雅，秩序良好。
学校先后被评为汕头市绿色学校、汕头市示范家长学校、汕头市体育传统项目（田径）学校、南澳县文明学校、南澳县一级学校、南澳县禁毒先进单位、南澳法制教育先进单位等。
南澳县第二中学是一所规模较大的县城初级中学，学生来源于县城后宅镇的小学毕业生。现有23个教学班，在校生1245人，学校位于县城后宅镇后江尖石山脚，占地面积22683平方米，建筑面积7268平方米，教学大楼（六层）建筑面积6450平方米，学校现无危房教室。
学校现建有物理实验室、电脑室、仪器室各2间;化学实验室、生物实验室及其配套仪器室各1间;多媒体电教室、语音室、音乐室、美术室、图书室、广播室、多功能厅各1间;体育器材室3间。拥有足够的行政、生活用户，够满足师生教育教学活动的需要。教学仪器、设施基本达到国家规定的二类标准。图书总册数26502册。体育器材按国家三类标准配备，基本满足体育课教学及课外体育活动锻炼要求的体育活动场地，现已建成200米环形跑道操场，标准篮球场1个。
