重庆市清华中学渊源于清华大学，创建于1938年。因筹办者和主要任课教师均系清华大学校友，经清华大学校政当局和校友总会同意，学校命名为重庆清华中学，首任校长傅任敢先生亦为清华大学校长梅贻琦先生委派。解放后学校由政府接办，更名为“重庆市第九中学”，1984年恢复“重庆清华中学”校名，全国政协主席邓颖超同志亲笔题写校名。1982年学校列为四川省首批重点中学，1999年被确认为重庆直辖后首批市级重点中学，2000年被评为“重庆市最佳文明单位”，2006年被教育部批准为“中外合作办学项目学校”,2007年被国家汉办、重庆市教委批准为“汉语国际推广基地学校”，被国家环保总局、教育部命名为“全国绿色环保学校”。目前，著名数学家、中科院院士王元先生担任重庆市清华中学首席顾问，研究员级教师尹先国同志担任重庆市清华中学校长、党委书记。
重庆清华中学自创办以来,一直秉承清华大学“求实”校风和“自强不息”校训，艰苦创业，奋发图强。近七十年风雨兼程，学校已发展成为一所占地230余亩，建筑面积11万多平方米，拥有80多个教学班、4000多名在校学生、住校生2800余人的大型寄宿制高中。学校先后培养出以两弹元勋、中国工程院院长朱光亚为代表的七位中国科学院、中国工程院院士和一大批专家、学者及党政军界杰出人才。“水木清华”以其优美的校园环境、雄厚的师资力量、完善的设施设备、光荣的办学传统、悠久的育人历史、深厚的文化底蕴被誉为重庆主城区的“育人乐土，求学圣地”。
