南投縣草屯國小創立至今已有106年的歷史，是縣內少數具有百年校史的學校之一，從日據時期沿革至今，學校還歷經921震災校舍重建，在師生共同努力下，學校在電腦與英語教學上均有優異表現，百年老校風華再現，許多畢業於草屯國小的老校友就是最佳的見證。
草屯國小係於民國前13年獲准創設為「草鞋墩公學校」，由渥美寬藏擔任首任校長。後因日本人的地名簡化政策，以及民國9年於台灣實施的地方制度，將所有地名有墩字者均改為屯，致使草鞋墩改為草屯，草鞋墩公學校也於民國10年正式改名為「草屯公學校」，後因實施國民學校制度，草屯公學校易名為「草屯東國民學校」。
至民國34年，日本無條件投降之後，由洪支山先生擔任光復後首任校長，草屯東國民學校再更名為「草屯國民學校」。民國57年，因應政府義務教育延長九年政策，再改名為「草屯國民小學」。
由於草鞋敦公學校於西元1904年的落成啟用，使草屯地區的子弟有永久的校地，十年樹木，百年樹人，從此莘莘學子孜孜不倦。第一屆唯一的畢業生洪元煌，其師承李春盛，兩人在世時均為「嘩水也結凍」的大號人物。其中，李春聖先生家族對草屯市區圓環舊街的起造功不可沒。
921地震過後，學校校舍毀損嚴重，經自由時報創辦人林榮三與社長吳阿明共同成立愛心專戶，匯集海內外愛心捐款，同心為災區付出真摯的關懷，協助學校新建南棟大樓教室17間，其設計充分表現出古樸與典雅的風格，其硬體設備包括有多媒體視聽教室、配備齊全的電腦教室，以及自動化且有聲的圖書館，在在展現出隨時代在進步的教育經營理念。另外，教室空間亦配置學習角及閱讀區，隨時可提供師生無盡創意空間，養成學生隨時能閱讀並且喜歡閱讀的好習慣。
草屯國小在電腦與英語教學上，大力投入獲得許多優異成績，並培養學生自主學習及解決問題能力，為未來與國際社會接軌做準備。
