本校創立於日據時代昭和12年(民國26年),民國34年10月25日台灣光復後隸屬於台中縣仁愛鄉親愛國民學校,民國35年8月由陳動材先生擔任首任校長;民國39年底才改為南投縣仁愛鄉親愛國民學校;政府鑑於偏遠地區原住民孩子營養普遍嚴重不良,於是民國50年5月開辦學生營養午餐,並特別供應牛奶補充營養;直到民國57年9月1日實施九年國民義務教育後,正式命名為「南投縣仁愛鄉親愛國民小學」。
本校所屬萬大分校成立於國46年,原為台灣電力公司萬大發電廠員工子弟學校,設有小學部6班及幼稚班2班,民國76年分校移撥南投縣政府,並裁撤幼稚班,正式隸屬於親愛國小;
國幼班成立於民國94年8月1日,為因應國民教育向下延伸一年的政策,並提供原住民地區五歲幼兒就學機會、改善受教環境及保障受教品質,以減緩原住民地區與都會地區城鄉差距和確保原住民地區教育機會均等必要的作為。
目前本分校各有6班計12班,外加國幼班一班,學童總人數104名,教職員工29名(含壹名替代役、兩名廚工、兩名值勤員)。學區是包括親愛、松林二個部落及萬大社區三個聚落,分屬泰雅族(澤敖列亞族)、賽德克族(太魯閣語系)、漢族(閩南、客家)等族群。