馬公國小自西元1899年設校至今，已經走過111個年頭。傳統的校園空間與退休教師都已相繼完成時代的使命，功成身退，承之而起的是嶄新的學習空間與熱情滿盈的教師團隊，以「創藝‧活力‧關懷‧永續」為我們的學校願景，承先啟後。「願景」象徵的是希望和理想，我們學校的願景是全體師生和家長所共有的意念以及共享的未來。茲簡述如下：
「創藝」—體認世界的快速變遷，教學更應創新多元。勤於學習之外，更要鼓勵小朋友結合自己的興趣專長，發揮潛能、揮灑創意。本校是藝術與人文重點學校，擁有全縣唯一的音樂班與舞蹈班，師資陣容堅強，全校「藝術與人文」課程皆能共享，除能開發小朋友的藝術潛能，在學習上又能有多樣化的內涵，我們期盼能培養更多創意與藝術兼備的馬小人。
「活力」—我們讓小朋友在快樂中學習，在健康中成長，以培養五育均衡發展、充滿活力的好兒童。本校的小朋友允文允武，日前甫榮獲全縣溜冰比賽團體四連霸，籃球隊亦取得全國籃球聯賽代表權，音樂、舞蹈與各領域也皆有良好的表現，小朋友多元智慧的啟發和多元能力的培育，正是本校努力的目標。
「關懷」—國民小學階段的兒童正處於人格的發展期，因此，學校不能忽視小朋友的道德教育。本校正努力藉由「品德教育」方案來培養小朋友的道德素質，以「尊重」與「關懷」為核心，試圖幫助小朋友培養現代化的民主素養—能包容不同意見並平等對待他人與各族群、能尊重生命並積極主動關懷社會和自然環境，能遵守法治與團體規範並發揮團隊合作的精神。
「永續」—學校要能永續經營，校長必須具備精緻的辦學理念以帶動學校活力，教師群要有「專業」和「敬業」的態度，也要有「主動」和「積極」的行政團隊，才能使學校成為小朋友學習的樂園。當然，背後更必須要有廣大的家長認同與支持。馬公國小一直朝向這樣的目標努力，期能帶好每一位小朋友，戮力追求卓越，營造一所優質的學校。
