国立金门高级中学是金门县唯一一所高中，座落于金城镇，其前身为金城的金中中学与金沙的金东中学，于1951年9月3日成立福建省立金门中学，1954年九三炮战爆发，迁校至陈坑村，1958年八二三炮战爆发，全校师生疏迁至台湾本岛分散至各公立中学借读。1960年于现址复校。
1964年率先施行九年国教停止招收初中新生，1967年停办初中部（即今国中学制的7至9年级），1972年易名为福建省立金门高级中学。1975年8月将职业类科及技训中心迁往山外太湖畔成立分部，并于1981年8月独立设校（今国立金门高级农工职业学校），1984年7月改隶教育部门管辖并改为今名：国立金门高级中学。
