本校應於民國四十五年四月十七日創立。校現址原為日人東山小學舊址,當時僅有舊教室七間,設校之初,定名為新竹縣立新竹第二女子初級中學。民國五十七年,國民教育延長為九年,改名為新竹縣立培英國民中學,民國七十一年,本市改制為省轄市,本校再改今名為新竹市立培英國民中學。本校創立之初,僅設六班,學生三百人,於四十五學年度第一學期開始上課,歷任校長為:周秉維 先生、王淑英 女士、武純仁 先生、景芳玉 女士、陳從傑 先生 、許文輝 先生,在建校於四十餘年間,校舍班級歷年遞增,計現有班級四十五班,學生一千餘人,教職員工一百餘人,校舍八十三間,禮堂一座,校地三點九七五五公頃。
現任洪碧霜校長於民國九十六年五月十八日奉調本校,到職以來,就本校既有規模,戮力充實各項設施,加強教輔工作,目前校務行政、學生課業及讀書風氣諸方面,皆有極速進步,並獲家長與社區人士好評。